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Commit 965efd3d authored by ronan.vignard's avatar ronan.vignard
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9 merge requests!32Passage en version 1.2.2,!31Mise à jour des vignettes suite à l'intégration du millésime 2024,!30Mise à jour des procédures en lien avec le millésime 2024 + Actualisation du README,!29Correction du lien vers l'image pour le site pkgdown,!28Passage en version 1.2.1,!27Finalisation de l'actualisation de la nouvelle logique métier,!26Création d'une table unique des prélèvements et analyses,!24Passage en version 1.2.0,!23Correctifs + documentation
Showing
with 43 additions and 41 deletions
......@@ -122,7 +122,7 @@ nitrate_data_analyse_ars <- nitrate_data_analyse_ars |>
On ajoute un identifiant unique s'appuyant sur une séquence stockée en base :
```{r add_code_prelevement_ars, eval=FALSE}
# Utiliser la fonction add_code_prelevement_ars avec la version souhaitée
# Utiliser la fonction add_code_prelevement() avec la version souhaitée
nitrate_data_analyse_ars <- add_code_prelevement(
nitrate_data_analyse_ars, version)
......
......@@ -142,7 +142,7 @@ nitrate_qualite_nappes_analyses <- nitrate_qualite_nappes_analyses |>
On ajoute un identifiant unique s'appuyant sur une séquence stockée en base :
```{r add_code_analyse_hubeau_eso, eval=FALSE}
# Utiliser la fonction add_code_analyse_ars avec la version souhaitée
# Utiliser la fonction add_code_analyse() avec la version souhaitée
nitrate_qualite_nappes_analyses <- add_code_analyse(
nitrate_qualite_nappes_analyses, version)
......
......@@ -96,7 +96,7 @@ nitrate_qualite_nappes_prelevements <- nitrate_qualite_nappes_prelevements |>
On ajoute un identifiant unique s'appuyant sur une séquence stockée en base :
```{r add_code_prelevement_hubeau_eso, eval=FALSE}
# Utiliser la fonction add_code_prelevement avec la version souhaitée
# Utiliser la fonction add_code_prelevement() avec la version souhaitée
nitrate_qualite_nappes_prelevements <- add_code_prelevement(
nitrate_qualite_nappes_prelevements, version)
......
......@@ -132,7 +132,7 @@ nitrate_qualite_rivieres_analyses <- nitrate_qualite_rivieres_analyses |>
On ajoute un identifiant unique s'appuyant sur une séquence stockée en base :
```{r add_code_analyse_hubeau_esu, eval=FALSE}
# Utiliser la fonction add_code_analyse_ars avec la version souhaitée
# Utiliser la fonction add_code_analyse() avec la version souhaitée
nitrate_qualite_rivieres_analyses <- add_code_analyse(
nitrate_qualite_rivieres_analyses, version)
......
......@@ -98,7 +98,7 @@ nitrate_qualite_rivieres_prelevements <- nitrate_qualite_rivieres_prelevements |
On ajoute un identifiant unique s'appuyant sur une séquence stockée en base :
```{r add_code_prelevement_hubeau_esu, eval=FALSE}
# Utiliser la fonction add_code_prelevement avec la version souhaitée
# Utiliser la fonction add_code_prelevement() avec la version souhaitée
nitrate_qualite_rivieres_prelevements <- add_code_prelevement(
nitrate_qualite_rivieres_prelevements, version)
......
......@@ -25,9 +25,8 @@ pkgload::load_all(export_all = FALSE)
# Lire le fichier de configuration
config <- yaml::read_yaml("config.yml")
# Accéder aux valeurs pour version et last_year
# Accéder à la valeur pour version
version <- config$version
last_year <- config$last_year
```
# Consolidation et insertion des analyses Hub'eau ESO dans la table des analyses
......@@ -143,7 +142,7 @@ nitrate_qualite_nappes_analyses <- nitrate_qualite_nappes_analyses |>
On ajoute un identifiant unique s'appuyant sur une séquence stockée en base :
```{r add_code_analyse_hubeau_eso, eval=FALSE}
# Utiliser la fonction add_code_analyse_ars avec la version souhaitée
# Utiliser la fonction add_code_analyse() avec la version souhaitée
nitrate_qualite_nappes_analyses <- add_code_analyse(
nitrate_qualite_nappes_analyses, version)
......
......@@ -25,9 +25,8 @@ pkgload::load_all(export_all = FALSE)
# Lire le fichier de configuration
config <- yaml::read_yaml("config.yml")
# Accéder aux valeurs pour version et last_year
# Accéder à la valeur pour version
version <- config$version
last_year <- config$last_year
```
# Consolidation et insertion des analyses Hub'eau ESU dans la table des analyses
......@@ -133,7 +132,7 @@ nitrate_qualite_rivieres_analyses <- nitrate_qualite_rivieres_analyses |>
On ajoute un identifiant unique s'appuyant sur une séquence stockée en base :
```{r add_code_analyse_hubeau_esu, eval=FALSE}
# Utiliser la fonction add_code_analyse_ars avec la version souhaitée
# Utiliser la fonction add_code_analyse() avec la version souhaitée
nitrate_qualite_rivieres_analyses <- add_code_analyse(
nitrate_qualite_rivieres_analyses, version)
......
......@@ -25,9 +25,8 @@ pkgload::load_all(export_all = FALSE)
# Lire le fichier de configuration
config <- yaml::read_yaml("config.yml")
# Accéder aux valeurs pour version et last_year
# Accéder à la valeur pour version
version <- config$version
last_year <- config$last_year
```
# Consolidation et insertion des données de l'ARS dans la table des prélèvements
......@@ -123,7 +122,7 @@ nitrate_data_analyse_ars <- nitrate_data_analyse_ars |>
On ajoute un identifiant unique s'appuyant sur une séquence stockée en base :
```{r add_code_prelevement_ars, eval=FALSE}
# Utiliser la fonction add_code_prelevement_ars avec la version souhaitée
# Utiliser la fonction add_code_prelevement() avec la version souhaitée
nitrate_data_analyse_ars <- add_code_prelevement(
nitrate_data_analyse_ars, version)
......@@ -158,8 +157,8 @@ collectr::import_and_merge_tables(database = "si_eau",
```
```{r development-skeleton, eval=FALSE}
# Créer de l'arborescence et des fichiers du template
```{r development-skeleton-dir, eval=FALSE}
# Créer initialement l'arborescence et des fichiers du template
usethis::use_rmarkdown_template(
template_name = "Insertion des pr\u00e9l\u00e8vements ARS",
template_dir = "insertion-des-prelevements-ars",
......@@ -167,6 +166,9 @@ usethis::use_rmarkdown_template(
template_create_dir = TRUE
)
```
```{r development-skeleton-copy, eval=FALSE}
# Définir les chemins source et destination
source_file <- "dev/flat_insert_ars_into_prelevement.Rmd"
destination_dir <- "inst/rmarkdown/templates/insertion-des-prelevements-ars/skeleton"
......
......@@ -25,9 +25,8 @@ pkgload::load_all(export_all = FALSE)
# Lire le fichier de configuration
config <- yaml::read_yaml("config.yml")
# Accéder aux valeurs pour version et last_year
# Accéder à la valeur pour version
version <- config$version
last_year <- config$last_year
```
# Consolidation et insertion des données Hub'eau ESO dans la table des prélèvements
......@@ -97,7 +96,7 @@ nitrate_qualite_nappes_prelevements <- nitrate_qualite_nappes_prelevements |>
On ajoute un identifiant unique s'appuyant sur une séquence stockée en base :
```{r add_code_prelevement_hubeau_eso, eval=FALSE}
# Utiliser la fonction add_code_prelevement avec la version souhaitée
# Utiliser la fonction add_code_prelevement() avec la version souhaitée
nitrate_qualite_nappes_prelevements <- add_code_prelevement(
nitrate_qualite_nappes_prelevements, version)
......@@ -132,8 +131,8 @@ collectr::import_and_merge_tables(database = "si_eau",
```
```{r development-skeleton, eval=FALSE}
# Créer de l'arborescence et des fichiers du template
```{r development-skeleton-dir, eval=FALSE}
# Créer initialement l'arborescence et des fichiers du template
usethis::use_rmarkdown_template(
template_name = "Insertion des pr\u00e9l\u00e8vements Hubeau ESO",
template_dir = "insertion-des-prelevements-hubeau-eso",
......@@ -141,6 +140,9 @@ usethis::use_rmarkdown_template(
template_create_dir = TRUE
)
```
```{r development-skeleton-copy, eval=FALSE}
# Définir les chemins source et destination
source_file <- "dev/flat_insert_hubeau_eso_into_prelevement.Rmd"
destination_dir <- "inst/rmarkdown/templates/insertion-des-prelevements-hubeau-eso/skeleton"
......
......@@ -25,9 +25,8 @@ pkgload::load_all(export_all = FALSE)
# Lire le fichier de configuration
config <- yaml::read_yaml("config.yml")
# Accéder aux valeurs pour version et last_year
# Accéder à la valeur pour version
version <- config$version
last_year <- config$last_year
```
# Consolidation et insertion des données Hub'eau ESU dans la table des prélèvements
......@@ -99,7 +98,7 @@ nitrate_qualite_rivieres_prelevements <- nitrate_qualite_rivieres_prelevements |
On ajoute un identifiant unique s'appuyant sur une séquence stockée en base :
```{r add_code_prelevement_hubeau_esu, eval=FALSE}
# Utiliser la fonction add_code_prelevement avec la version souhaitée
# Utiliser la fonction add_code_prelevement() avec la version souhaitée
nitrate_qualite_rivieres_prelevements <- add_code_prelevement(
nitrate_qualite_rivieres_prelevements, version)
......@@ -134,8 +133,8 @@ collectr::import_and_merge_tables(database = "si_eau",
```
```{r development-skeleton, eval=FALSE}
# Créer de l'arborescence et des fichiers du template
```{r development-skeleton-dir, eval=FALSE}
# Créer initialement l'arborescence et des fichiers du template
usethis::use_rmarkdown_template(
template_name = "Insertion des pr\u00e9l\u00e8vements Hubeau ESU",
template_dir = "insertion-des-prelevements-hubeau-esu",
......@@ -143,6 +142,9 @@ usethis::use_rmarkdown_template(
template_create_dir = TRUE
)
```
```{r development-skeleton-copy, eval=FALSE}
# Définir les chemins source et destination
source_file <- "dev/flat_insert_hubeau_esu_into_prelevement.Rmd"
destination_dir <- "inst/rmarkdown/templates/insertion-des-prelevements-hubeau-esu/skeleton"
......
......@@ -29,9 +29,8 @@ library(data.nitrates)
# Lire le fichier de configuration
config <- yaml::read_yaml("config.yml")
# Accéder aux valeurs pour version et last_year
# Accéder à la valeur pour version
version <- config$version
last_year <- config$last_year
```
......@@ -177,7 +176,7 @@ On ajoute un identifiant unique s'appuyant sur une séquence stockée en base :
```{r add_code_analyse_hubeau_eso}
#| eval: no
# Utiliser la fonction add_code_analyse_ars avec la version souhaitée
# Utiliser la fonction add_code_analyse() avec la version souhaitée
nitrate_qualite_nappes_analyses <- add_code_analyse(
nitrate_qualite_nappes_analyses, version)
......
......@@ -29,9 +29,8 @@ library(data.nitrates)
# Lire le fichier de configuration
config <- yaml::read_yaml("config.yml")
# Accéder aux valeurs pour version et last_year
# Accéder à la valeur pour version
version <- config$version
last_year <- config$last_year
```
......@@ -164,7 +163,7 @@ On ajoute un identifiant unique s'appuyant sur une séquence stockée en base :
```{r add_code_analyse_hubeau_esu}
#| eval: no
# Utiliser la fonction add_code_analyse_ars avec la version souhaitée
# Utiliser la fonction add_code_analyse() avec la version souhaitée
nitrate_qualite_rivieres_analyses <- add_code_analyse(
nitrate_qualite_rivieres_analyses, version)
......
......@@ -29,9 +29,8 @@ library(data.nitrates)
# Lire le fichier de configuration
config <- yaml::read_yaml("config.yml")
# Accéder aux valeurs pour version et last_year
# Accéder à la valeur pour version
version <- config$version
last_year <- config$last_year
```
......@@ -154,7 +153,7 @@ On ajoute un identifiant unique s'appuyant sur une séquence stockée en base :
```{r add_code_prelevement_ars}
#| eval: no
# Utiliser la fonction add_code_prelevement_ars avec la version souhaitée
# Utiliser la fonction add_code_prelevement() avec la version souhaitée
nitrate_data_analyse_ars <- add_code_prelevement(
nitrate_data_analyse_ars, version)
......@@ -198,3 +197,4 @@ collectr::import_and_merge_tables(database = "si_eau",
......@@ -29,9 +29,8 @@ library(data.nitrates)
# Lire le fichier de configuration
config <- yaml::read_yaml("config.yml")
# Accéder aux valeurs pour version et last_year
# Accéder à la valeur pour version
version <- config$version
last_year <- config$last_year
```
......@@ -122,7 +121,7 @@ On ajoute un identifiant unique s'appuyant sur une séquence stockée en base :
```{r add_code_prelevement_hubeau_eso}
#| eval: no
# Utiliser la fonction add_code_prelevement avec la version souhaitée
# Utiliser la fonction add_code_prelevement() avec la version souhaitée
nitrate_qualite_nappes_prelevements <- add_code_prelevement(
nitrate_qualite_nappes_prelevements, version)
......@@ -166,3 +165,4 @@ collectr::import_and_merge_tables(database = "si_eau",
......@@ -29,9 +29,8 @@ library(data.nitrates)
# Lire le fichier de configuration
config <- yaml::read_yaml("config.yml")
# Accéder aux valeurs pour version et last_year
# Accéder à la valeur pour version
version <- config$version
last_year <- config$last_year
```
......@@ -124,7 +123,7 @@ On ajoute un identifiant unique s'appuyant sur une séquence stockée en base :
```{r add_code_prelevement_hubeau_esu}
#| eval: no
# Utiliser la fonction add_code_prelevement avec la version souhaitée
# Utiliser la fonction add_code_prelevement() avec la version souhaitée
nitrate_qualite_rivieres_prelevements <- add_code_prelevement(
nitrate_qualite_rivieres_prelevements, version)
......@@ -168,3 +167,4 @@ collectr::import_and_merge_tables(database = "si_eau",
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