diff --git a/dev/flat_insert_ars_into_prelevement.Rmd b/dev/flat_insert_ars_into_prelevement.Rmd index ad96c14ab0db60b674a0a3c15f88a52f87250d4d..8136fdbc6def6f4f7da124cd0560fc056a26f68f 100644 --- a/dev/flat_insert_ars_into_prelevement.Rmd +++ b/dev/flat_insert_ars_into_prelevement.Rmd @@ -122,7 +122,7 @@ nitrate_data_analyse_ars <- nitrate_data_analyse_ars |> On ajoute un identifiant unique s'appuyant sur une séquence stockée en base : ```{r add_code_prelevement_ars, eval=FALSE} -# Utiliser la fonction add_code_prelevement_ars avec la version souhaitée +# Utiliser la fonction add_code_prelevement() avec la version souhaitée nitrate_data_analyse_ars <- add_code_prelevement( nitrate_data_analyse_ars, version) diff --git a/dev/flat_insert_hubeau_eso_into_analyse.Rmd b/dev/flat_insert_hubeau_eso_into_analyse.Rmd index 6655e54a96b6a97af9eaa5853783789516f335c8..155ee67b0d0ca6bb0d76bcc49546e5b802e3a09c 100644 --- a/dev/flat_insert_hubeau_eso_into_analyse.Rmd +++ b/dev/flat_insert_hubeau_eso_into_analyse.Rmd @@ -142,7 +142,7 @@ nitrate_qualite_nappes_analyses <- nitrate_qualite_nappes_analyses |> On ajoute un identifiant unique s'appuyant sur une séquence stockée en base : ```{r add_code_analyse_hubeau_eso, eval=FALSE} -# Utiliser la fonction add_code_analyse_ars avec la version souhaitée +# Utiliser la fonction add_code_analyse() avec la version souhaitée nitrate_qualite_nappes_analyses <- add_code_analyse( nitrate_qualite_nappes_analyses, version) diff --git a/dev/flat_insert_hubeau_eso_into_prelevement.Rmd b/dev/flat_insert_hubeau_eso_into_prelevement.Rmd index 839cb2d8fbc021c547e26a7b18279433d808aa96..17e7005cd3d1fe1d2b8b94064cadfcfc04445691 100644 --- a/dev/flat_insert_hubeau_eso_into_prelevement.Rmd +++ b/dev/flat_insert_hubeau_eso_into_prelevement.Rmd @@ -96,7 +96,7 @@ nitrate_qualite_nappes_prelevements <- nitrate_qualite_nappes_prelevements |> On ajoute un identifiant unique s'appuyant sur une séquence stockée en base : ```{r add_code_prelevement_hubeau_eso, eval=FALSE} -# Utiliser la fonction add_code_prelevement avec la version souhaitée +# Utiliser la fonction add_code_prelevement() avec la version souhaitée nitrate_qualite_nappes_prelevements <- add_code_prelevement( nitrate_qualite_nappes_prelevements, version) diff --git a/dev/flat_insert_hubeau_esu_into_analyse.Rmd b/dev/flat_insert_hubeau_esu_into_analyse.Rmd index 5c8863a17311cb0e39f59a1f58c45e2bb7683d87..73c74292fb0383efebae5fa25aead34f7c3579d6 100644 --- a/dev/flat_insert_hubeau_esu_into_analyse.Rmd +++ b/dev/flat_insert_hubeau_esu_into_analyse.Rmd @@ -132,7 +132,7 @@ nitrate_qualite_rivieres_analyses <- nitrate_qualite_rivieres_analyses |> On ajoute un identifiant unique s'appuyant sur une séquence stockée en base : ```{r add_code_analyse_hubeau_esu, eval=FALSE} -# Utiliser la fonction add_code_analyse_ars avec la version souhaitée +# Utiliser la fonction add_code_analyse() avec la version souhaitée nitrate_qualite_rivieres_analyses <- add_code_analyse( nitrate_qualite_rivieres_analyses, version) diff --git a/dev/flat_insert_hubeau_esu_into_prelevement.Rmd b/dev/flat_insert_hubeau_esu_into_prelevement.Rmd index 23432b596ffb0413781a3616255565e91f76f73f..595e5fb99b9bc13bbfd35d98e30cbc561270cff8 100644 --- a/dev/flat_insert_hubeau_esu_into_prelevement.Rmd +++ b/dev/flat_insert_hubeau_esu_into_prelevement.Rmd @@ -98,7 +98,7 @@ nitrate_qualite_rivieres_prelevements <- nitrate_qualite_rivieres_prelevements | On ajoute un identifiant unique s'appuyant sur une séquence stockée en base : ```{r add_code_prelevement_hubeau_esu, eval=FALSE} -# Utiliser la fonction add_code_prelevement avec la version souhaitée +# Utiliser la fonction add_code_prelevement() avec la version souhaitée nitrate_qualite_rivieres_prelevements <- add_code_prelevement( nitrate_qualite_rivieres_prelevements, version) diff --git a/inst/rmarkdown/templates/insertion-des-analyses-hubeau-eso/skeleton/skeleton.Rmd b/inst/rmarkdown/templates/insertion-des-analyses-hubeau-eso/skeleton/skeleton.Rmd index 5b93e1b7a3b31485b3fe49cbc3234d67a4ae4eaa..155ee67b0d0ca6bb0d76bcc49546e5b802e3a09c 100644 --- a/inst/rmarkdown/templates/insertion-des-analyses-hubeau-eso/skeleton/skeleton.Rmd +++ b/inst/rmarkdown/templates/insertion-des-analyses-hubeau-eso/skeleton/skeleton.Rmd @@ -25,9 +25,8 @@ pkgload::load_all(export_all = FALSE) # Lire le fichier de configuration config <- yaml::read_yaml("config.yml") -# Accéder aux valeurs pour version et last_year +# Accéder à la valeur pour version version <- config$version -last_year <- config$last_year ``` # Consolidation et insertion des analyses Hub'eau ESO dans la table des analyses @@ -143,7 +142,7 @@ nitrate_qualite_nappes_analyses <- nitrate_qualite_nappes_analyses |> On ajoute un identifiant unique s'appuyant sur une séquence stockée en base : ```{r add_code_analyse_hubeau_eso, eval=FALSE} -# Utiliser la fonction add_code_analyse_ars avec la version souhaitée +# Utiliser la fonction add_code_analyse() avec la version souhaitée nitrate_qualite_nappes_analyses <- add_code_analyse( nitrate_qualite_nappes_analyses, version) diff --git a/inst/rmarkdown/templates/insertion-des-analyses-hubeau-esu/skeleton/skeleton.Rmd b/inst/rmarkdown/templates/insertion-des-analyses-hubeau-esu/skeleton/skeleton.Rmd index a56efcdfab55f3d796491f60e1c7186872b233a5..73c74292fb0383efebae5fa25aead34f7c3579d6 100644 --- a/inst/rmarkdown/templates/insertion-des-analyses-hubeau-esu/skeleton/skeleton.Rmd +++ b/inst/rmarkdown/templates/insertion-des-analyses-hubeau-esu/skeleton/skeleton.Rmd @@ -25,9 +25,8 @@ pkgload::load_all(export_all = FALSE) # Lire le fichier de configuration config <- yaml::read_yaml("config.yml") -# Accéder aux valeurs pour version et last_year +# Accéder à la valeur pour version version <- config$version -last_year <- config$last_year ``` # Consolidation et insertion des analyses Hub'eau ESU dans la table des analyses @@ -133,7 +132,7 @@ nitrate_qualite_rivieres_analyses <- nitrate_qualite_rivieres_analyses |> On ajoute un identifiant unique s'appuyant sur une séquence stockée en base : ```{r add_code_analyse_hubeau_esu, eval=FALSE} -# Utiliser la fonction add_code_analyse_ars avec la version souhaitée +# Utiliser la fonction add_code_analyse() avec la version souhaitée nitrate_qualite_rivieres_analyses <- add_code_analyse( nitrate_qualite_rivieres_analyses, version) diff --git a/inst/rmarkdown/templates/insertion-des-prelevements-ars/skeleton/skeleton.Rmd b/inst/rmarkdown/templates/insertion-des-prelevements-ars/skeleton/skeleton.Rmd index 2931a8d2f8536bd4fc187df47db211f3be9a5c4a..8136fdbc6def6f4f7da124cd0560fc056a26f68f 100644 --- a/inst/rmarkdown/templates/insertion-des-prelevements-ars/skeleton/skeleton.Rmd +++ b/inst/rmarkdown/templates/insertion-des-prelevements-ars/skeleton/skeleton.Rmd @@ -25,9 +25,8 @@ pkgload::load_all(export_all = FALSE) # Lire le fichier de configuration config <- yaml::read_yaml("config.yml") -# Accéder aux valeurs pour version et last_year +# Accéder à la valeur pour version version <- config$version -last_year <- config$last_year ``` # Consolidation et insertion des données de l'ARS dans la table des prélèvements @@ -123,7 +122,7 @@ nitrate_data_analyse_ars <- nitrate_data_analyse_ars |> On ajoute un identifiant unique s'appuyant sur une séquence stockée en base : ```{r add_code_prelevement_ars, eval=FALSE} -# Utiliser la fonction add_code_prelevement_ars avec la version souhaitée +# Utiliser la fonction add_code_prelevement() avec la version souhaitée nitrate_data_analyse_ars <- add_code_prelevement( nitrate_data_analyse_ars, version) @@ -158,8 +157,8 @@ collectr::import_and_merge_tables(database = "si_eau", ``` -```{r development-skeleton, eval=FALSE} -# Créer de l'arborescence et des fichiers du template +```{r development-skeleton-dir, eval=FALSE} +# Créer initialement l'arborescence et des fichiers du template usethis::use_rmarkdown_template( template_name = "Insertion des pr\u00e9l\u00e8vements ARS", template_dir = "insertion-des-prelevements-ars", @@ -167,6 +166,9 @@ usethis::use_rmarkdown_template( template_create_dir = TRUE ) +``` + +```{r development-skeleton-copy, eval=FALSE} # Définir les chemins source et destination source_file <- "dev/flat_insert_ars_into_prelevement.Rmd" destination_dir <- "inst/rmarkdown/templates/insertion-des-prelevements-ars/skeleton" diff --git a/inst/rmarkdown/templates/insertion-des-prelevements-hubeau-eso/skeleton/skeleton.Rmd b/inst/rmarkdown/templates/insertion-des-prelevements-hubeau-eso/skeleton/skeleton.Rmd index 94a8a53d035afe7bce054b834f633f1b014263c1..17e7005cd3d1fe1d2b8b94064cadfcfc04445691 100644 --- a/inst/rmarkdown/templates/insertion-des-prelevements-hubeau-eso/skeleton/skeleton.Rmd +++ b/inst/rmarkdown/templates/insertion-des-prelevements-hubeau-eso/skeleton/skeleton.Rmd @@ -25,9 +25,8 @@ pkgload::load_all(export_all = FALSE) # Lire le fichier de configuration config <- yaml::read_yaml("config.yml") -# Accéder aux valeurs pour version et last_year +# Accéder à la valeur pour version version <- config$version -last_year <- config$last_year ``` # Consolidation et insertion des données Hub'eau ESO dans la table des prélèvements @@ -97,7 +96,7 @@ nitrate_qualite_nappes_prelevements <- nitrate_qualite_nappes_prelevements |> On ajoute un identifiant unique s'appuyant sur une séquence stockée en base : ```{r add_code_prelevement_hubeau_eso, eval=FALSE} -# Utiliser la fonction add_code_prelevement avec la version souhaitée +# Utiliser la fonction add_code_prelevement() avec la version souhaitée nitrate_qualite_nappes_prelevements <- add_code_prelevement( nitrate_qualite_nappes_prelevements, version) @@ -132,8 +131,8 @@ collectr::import_and_merge_tables(database = "si_eau", ``` -```{r development-skeleton, eval=FALSE} -# Créer de l'arborescence et des fichiers du template +```{r development-skeleton-dir, eval=FALSE} +# Créer initialement l'arborescence et des fichiers du template usethis::use_rmarkdown_template( template_name = "Insertion des pr\u00e9l\u00e8vements Hubeau ESO", template_dir = "insertion-des-prelevements-hubeau-eso", @@ -141,6 +140,9 @@ usethis::use_rmarkdown_template( template_create_dir = TRUE ) +``` + +```{r development-skeleton-copy, eval=FALSE} # Définir les chemins source et destination source_file <- "dev/flat_insert_hubeau_eso_into_prelevement.Rmd" destination_dir <- "inst/rmarkdown/templates/insertion-des-prelevements-hubeau-eso/skeleton" diff --git a/inst/rmarkdown/templates/insertion-des-prelevements-hubeau-esu/skeleton/skeleton.Rmd b/inst/rmarkdown/templates/insertion-des-prelevements-hubeau-esu/skeleton/skeleton.Rmd index 70e2525d1c26b31b4f29896f99fb37ca98b3e27d..595e5fb99b9bc13bbfd35d98e30cbc561270cff8 100644 --- a/inst/rmarkdown/templates/insertion-des-prelevements-hubeau-esu/skeleton/skeleton.Rmd +++ b/inst/rmarkdown/templates/insertion-des-prelevements-hubeau-esu/skeleton/skeleton.Rmd @@ -25,9 +25,8 @@ pkgload::load_all(export_all = FALSE) # Lire le fichier de configuration config <- yaml::read_yaml("config.yml") -# Accéder aux valeurs pour version et last_year +# Accéder à la valeur pour version version <- config$version -last_year <- config$last_year ``` # Consolidation et insertion des données Hub'eau ESU dans la table des prélèvements @@ -99,7 +98,7 @@ nitrate_qualite_rivieres_prelevements <- nitrate_qualite_rivieres_prelevements | On ajoute un identifiant unique s'appuyant sur une séquence stockée en base : ```{r add_code_prelevement_hubeau_esu, eval=FALSE} -# Utiliser la fonction add_code_prelevement avec la version souhaitée +# Utiliser la fonction add_code_prelevement() avec la version souhaitée nitrate_qualite_rivieres_prelevements <- add_code_prelevement( nitrate_qualite_rivieres_prelevements, version) @@ -134,8 +133,8 @@ collectr::import_and_merge_tables(database = "si_eau", ``` -```{r development-skeleton, eval=FALSE} -# Créer de l'arborescence et des fichiers du template +```{r development-skeleton-dir, eval=FALSE} +# Créer initialement l'arborescence et des fichiers du template usethis::use_rmarkdown_template( template_name = "Insertion des pr\u00e9l\u00e8vements Hubeau ESU", template_dir = "insertion-des-prelevements-hubeau-esu", @@ -143,6 +142,9 @@ usethis::use_rmarkdown_template( template_create_dir = TRUE ) +``` + +```{r development-skeleton-copy, eval=FALSE} # Définir les chemins source et destination source_file <- "dev/flat_insert_hubeau_esu_into_prelevement.Rmd" destination_dir <- "inst/rmarkdown/templates/insertion-des-prelevements-hubeau-esu/skeleton" diff --git a/vignettes/insertion-des-analyses-hubeau-eso.Rmd b/vignettes/insertion-des-analyses-hubeau-eso.Rmd index 5d7ce0d56111183015da643d8b408cd89a93fa8e..c4aba11e35a5b15ca86b23c2aa985ce68f3189b2 100644 --- a/vignettes/insertion-des-analyses-hubeau-eso.Rmd +++ b/vignettes/insertion-des-analyses-hubeau-eso.Rmd @@ -29,9 +29,8 @@ library(data.nitrates) # Lire le fichier de configuration config <- yaml::read_yaml("config.yml") -# Accéder aux valeurs pour version et last_year +# Accéder à la valeur pour version version <- config$version -last_year <- config$last_year ``` @@ -177,7 +176,7 @@ On ajoute un identifiant unique s'appuyant sur une séquence stockée en base : ```{r add_code_analyse_hubeau_eso} #| eval: no -# Utiliser la fonction add_code_analyse_ars avec la version souhaitée +# Utiliser la fonction add_code_analyse() avec la version souhaitée nitrate_qualite_nappes_analyses <- add_code_analyse( nitrate_qualite_nappes_analyses, version) diff --git a/vignettes/insertion-des-analyses-hubeau-esu.Rmd b/vignettes/insertion-des-analyses-hubeau-esu.Rmd index 7e3af132890cec31ada9e785da7d6a9477f862c5..62f802ce2e4107a706b87b3af598c343f9700b07 100644 --- a/vignettes/insertion-des-analyses-hubeau-esu.Rmd +++ b/vignettes/insertion-des-analyses-hubeau-esu.Rmd @@ -29,9 +29,8 @@ library(data.nitrates) # Lire le fichier de configuration config <- yaml::read_yaml("config.yml") -# Accéder aux valeurs pour version et last_year +# Accéder à la valeur pour version version <- config$version -last_year <- config$last_year ``` @@ -164,7 +163,7 @@ On ajoute un identifiant unique s'appuyant sur une séquence stockée en base : ```{r add_code_analyse_hubeau_esu} #| eval: no -# Utiliser la fonction add_code_analyse_ars avec la version souhaitée +# Utiliser la fonction add_code_analyse() avec la version souhaitée nitrate_qualite_rivieres_analyses <- add_code_analyse( nitrate_qualite_rivieres_analyses, version) diff --git a/vignettes/insertion-des-prelevements-ars.Rmd b/vignettes/insertion-des-prelevements-ars.Rmd index fa0e73cdd215f4f747d4c7f96870d81e8a53b23b..fd1555cda35acd98e6176f0fdbf2f6786c7b1b28 100644 --- a/vignettes/insertion-des-prelevements-ars.Rmd +++ b/vignettes/insertion-des-prelevements-ars.Rmd @@ -29,9 +29,8 @@ library(data.nitrates) # Lire le fichier de configuration config <- yaml::read_yaml("config.yml") -# Accéder aux valeurs pour version et last_year +# Accéder à la valeur pour version version <- config$version -last_year <- config$last_year ``` @@ -154,7 +153,7 @@ On ajoute un identifiant unique s'appuyant sur une séquence stockée en base : ```{r add_code_prelevement_ars} #| eval: no -# Utiliser la fonction add_code_prelevement_ars avec la version souhaitée +# Utiliser la fonction add_code_prelevement() avec la version souhaitée nitrate_data_analyse_ars <- add_code_prelevement( nitrate_data_analyse_ars, version) @@ -198,3 +197,4 @@ collectr::import_and_merge_tables(database = "si_eau", + diff --git a/vignettes/insertion-des-prelevements-hubeau-eso.Rmd b/vignettes/insertion-des-prelevements-hubeau-eso.Rmd index 9390f4f36c3a8aa09777db910565dfb6a560a57f..4057bba32e40f5753c4c78aaac42da08176cbaea 100644 --- a/vignettes/insertion-des-prelevements-hubeau-eso.Rmd +++ b/vignettes/insertion-des-prelevements-hubeau-eso.Rmd @@ -29,9 +29,8 @@ library(data.nitrates) # Lire le fichier de configuration config <- yaml::read_yaml("config.yml") -# Accéder aux valeurs pour version et last_year +# Accéder à la valeur pour version version <- config$version -last_year <- config$last_year ``` @@ -122,7 +121,7 @@ On ajoute un identifiant unique s'appuyant sur une séquence stockée en base : ```{r add_code_prelevement_hubeau_eso} #| eval: no -# Utiliser la fonction add_code_prelevement avec la version souhaitée +# Utiliser la fonction add_code_prelevement() avec la version souhaitée nitrate_qualite_nappes_prelevements <- add_code_prelevement( nitrate_qualite_nappes_prelevements, version) @@ -166,3 +165,4 @@ collectr::import_and_merge_tables(database = "si_eau", + diff --git a/vignettes/insertion-des-prelevements-hubeau-esu.Rmd b/vignettes/insertion-des-prelevements-hubeau-esu.Rmd index 00278219b017f69f728b8be6b5b6e3d5a897ec52..4c930d8e1b220bf03f7985c3f9e3002f461f8f76 100644 --- a/vignettes/insertion-des-prelevements-hubeau-esu.Rmd +++ b/vignettes/insertion-des-prelevements-hubeau-esu.Rmd @@ -29,9 +29,8 @@ library(data.nitrates) # Lire le fichier de configuration config <- yaml::read_yaml("config.yml") -# Accéder aux valeurs pour version et last_year +# Accéder à la valeur pour version version <- config$version -last_year <- config$last_year ``` @@ -124,7 +123,7 @@ On ajoute un identifiant unique s'appuyant sur une séquence stockée en base : ```{r add_code_prelevement_hubeau_esu} #| eval: no -# Utiliser la fonction add_code_prelevement avec la version souhaitée +# Utiliser la fonction add_code_prelevement() avec la version souhaitée nitrate_qualite_rivieres_prelevements <- add_code_prelevement( nitrate_qualite_rivieres_prelevements, version) @@ -168,3 +167,4 @@ collectr::import_and_merge_tables(database = "si_eau", +