data.nitrates

Objectif

L’objectif du package data.nitrates est de faciliter l’actualisation des lots de données suivants dans une base de données PostgreSQL locale.

Sources :

• Données de l’ARS : nitrates.nitrate_data_analyse_ars
• Données provenant de la plateforme Hub’eau :
  • API “Qualité des nappes d’eau souterraine” : qualite_nappes_eau_souterraine.nitrate_qualite_nappes_analyses
  • API “Qualité des cours d’eau” : qualite_cours_d_eau.hubeau_qualite_rivieres_station_pc

Livrables :

• Table des prélèvements : nitrates.nitrate_prelevement
• Table des analyses : nitrates.nitrate_analyse

Installation

Installer le package remotes si besoin :

install.packages("remotes")

Installer le package data.nitrates :

remotes::install_gitlab('dreal-pdl/csd/eau-milieux-aquatiques/data.nitrates', host="gitlab-forge.din.developpement-durable.gouv.fr")

Utilisation

Chargement du package

Charger le package data.nitrates dans la session :

library(data.nitrates)

Documentation

La documentation du package est consultable sur ce site : https://dreal-pdl.gitlab-pages.din.developpement-durable.gouv.fr/csd/eau-milieux-aquatiques/data.nitrates/

Chargement d’un template

Ouvrir un nouveau fichier RMarkdown via New File > Rmarkdown :

Sélectionner From Template dans la fenêtre puis le template souhaité parmi ceux proposés pour {data.nitrates} :

Un nouveau fichier .Rmd est créé à partir du template et peut être enregistré par l’utilisateur sur son poste de travail.

Il faut ensuite suivre les différentes étapes (en adaptant si besoin les paramètres) pour mettre à jour le lot de données concerné.