Merge branch 'rpls_cog2024_FG' into 'master'

fusion de la branche rpls_cog2024_FG

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.gitignore

@@ -11,3 +11,5 @@ _targets
 lib_var_RGE.csv
 metadata/*.RData
 sysdata/*.RData
+*.RData
+R/cog.R
\ No newline at end of file

data-raw/chargement_rpls.R

 
 # chargement_rpls
 
-# librairies -------
-library(propre.rpls)
-library(tidyr)
-library(tidyverse)
-library(COGiter)
-library(lubridate)
-library(readr)
-library(datalibaba)
-library(googlesheets4)
-
 rm(list = ls())
 
+library(magrittr) # pour le %>% 
+
 source(file = "R/dataprep_all.R")
 
 rpls_prep <- dataprep_all() %>% 
-  filter(!is.na(millesime))
+  dplyr::filter(!is.na(millesime))
 
-# #liste des communes des EPCI de la région Pays de la Loire
-# communes_region52 <- communes %>%
-#   filter(grepl("52", REGIONS_DE_L_EPCI)) %>%
-#   mutate(DEPCOM = as.character(DEPCOM))  %>%
-#   pull(DEPCOM)
+# # liste des communes des EPCI de la région Pays de la Loire
+# communes_region52 <- COGiter::communes %>%
+#   dplyr::filter(grepl("52", REGIONS_DE_L_EPCI)) %>%
+#   dplyr::mutate(DEPCOM = as.character(DEPCOM))  %>%
+#   dplyr::pull(DEPCOM)
 
 rpls <- rpls_prep %>%
-  # filter(TypeZone %in% c("Départements", "Régions", "Epci", "France") | CodeZone %in% communes_region52 ) %>%
-  mutate(date = make_date(as.character(millesime), 01, 01),
-         across(where(is.character), as.factor)) %>%
-  select(-millesime) %>%
-  mutate_if(is.factor, as.character)
-
-
-# dictionnaire de données  rpls et rp du package propre.rpls ------------
-
-# https://gitlab.com/rdes_dreal/propre.rpls/-/blob/master/inst/rstudio/templates/project/ressources/extdata/
-# dico_var.csv, dico_var_compl.csv et dico_var_rp.csv téléchargés dans exdata du projet sgbd_datamart
-
-url_dicos <- "https://gitlab.com/rdes_dreal/propre.rpls/-/raw/master/inst/rstudio/templates/project/ressources/extdata/"
-
-dico_var <- read_csv2(paste0(url_dicos, "dico_var.csv")) %>%
-  dplyr::bind_rows(read_csv2(paste0(url_dicos, "dico_var_compl.csv"))) %>%
-  dplyr::bind_rows(read_csv2(paste0(url_dicos, "dico_var_rp.csv"))) %>%
-  select(-c(Chapitre, usage))
-
-dico_var <- semi_join(dico_var, tibble(nom_court = names(rpls))) %>%
-  # ajout des libellés pour TypeZone CodeZone Zone et date
-  bind_rows(
-    tribble(
-      ~nom_court, ~libelles,
-      "TypeZone", "Type de zone" ,
-      "Zone" , "Nom de la zone",
-      "CodeZone" , "Code INSEE de la zone",
-      "date", "Millesime"
-    )
+  # dplyr::filter(TypeZone %in% c("Départements", "Régions", "Epci", "France") | CodeZone %in% communes_region52 ) %>%
+  dplyr::mutate(
+    date = lubridate::make_date(as.character(millesime), 01, 01),
+    dplyr::across(tidyselect::where(is.character), as.factor)
+    ) %>%
+  dplyr::select(-millesime) %>%
+  dplyr::mutate_if(is.factor, as.character)
+
+# versement et documentation dans le sgbd/datamart.portrait_territoires ------
+source("R/poster_documenter_ind.R", encoding = "UTF-8")
+poster_documenter_ind(
+  df = rpls,
+  nom_table_sgbd = "cogifiee_rpls", 
+  comm_source_en_plus = "Chargement des donn\u00e9es sur le package propre.rpls"
   )
 
-
-# # versement dans le sgbd/datamart.portrait_territoires et métadonnées -------------
-poster_data(data = rpls,
-            table = "cogifiee_rpls",
-            schema = "portrait_territoires",
-            db = "datamart",
-            user = "does",
-            pk = c("TypeZone", "CodeZone", "date"),
-            post_row_name = FALSE,
-            droits_schema = TRUE,
-            overwrite = TRUE)
-
-post_dico_attr(dico = dico_var,
-               table = "cogifiee_rpls",
-               schema = "portrait_territoires",
-               db = "datamart",
-               user = "does")
-
-## récupération du nom du présent script source
-nom_script_sce <- rstudioapi::getActiveDocumentContext()$path %>% # utilisation de rstudioapi pour récupérer le nom du présent script
-  basename() %>% # on enlève le chemin d'accès pour ne garder que le nom du fichier
-  gsub(pattern = ".R$", "", .) # on enlève l'extension '.R'
-
-
-## Récupération des métadonnées de la source
-nom_sce <- str_replace(nom_script_sce, "chargement_|ref_|specifique_", "") %>%
-  str_replace("indicateur_", "") %>%
-  str_replace("_cogiter|_cog$", "")
-
-## authentification google sheet grâce au .Renviron
-googlesheets4::gs4_auth_configure(api_key = Sys.getenv("google_api_key"))
-googlesheets4::gs4_deauth()
-
-metadata_source <- read_sheet("https://docs.google.com/spreadsheets/d/1n-dhtrJM3JwFVz5WSEGOQzQ8A0G7VT_VcxDe5gh6zSo/edit#gid=60292277",
-                              sheet = "sources") %>%
-  filter(source == nom_sce) %>%
-  mutate(com_table = paste0(source_lib, " - ", producteur, ".\n", descriptif_sources)) %>%
-  pull(com_table) %>%
-  # ajout de complement sur la généalogie
-  paste0(".\n", "Chargement des donn\u00e9es sur le package propre.rpls")
-
-## commentaires de la table
-commenter_table(comment = metadata_source,
-                db = "datamart",
-                schema = "portrait_territoires",
-                table = "cogifiee_rpls",
-                user = "does")
-
 rm(list = ls())