Créer une table unique des prélèvements et analyses

À l'étape de consolidation des données ARS et Hub'eau des tables distinctes nitrates.nitrate_analyse et nitrates.nitrate_prelevement sont créées alors que :

• les livrables ARS et Hub'eau ne font pas cette distinction
• l'alimentation de l'application conduit ensuite à joindre ces deux tables

À faire :

• dans une optique de simplification du code et de sa maintenabilité, évaluer la possibilité de supprimer cette scission initiale en prenant en compte les besoins éventuels de dédoublonnage des prélèvements : validé
• créer une table unique des prélèvement et analyses
• tester les résultats obtenus

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Principe d'une table unique nitrates.nitrate_prelevement_analyse validé.

Refonte de la procédure dans un .Rmd unique en cours :

• découpage provisoire en trois .Rmd prélèvements et analyses ARS + Hub'eau ESO + Hub'eau ESU qui seront rassemblés dans un seul document in fine
• champs heure_prelevement, id_usage, id_prelevement_motif présents seulement dans les données ARS
• champ code_reseau présent seulement dans les données Hub'eau
• 16 champs dans la table finale pour l'instant

Il faudra à terme simplifier le package :

• suppression de tous les .Rmd obsolètes et des fichiers générés
• bascule au format notebook de la procédure ?

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Bonjour @Franck.Gaspard J'ai créé une première version finalisée de la table unique nitrates.nitrate_prelevement_analyse_v0_20 avec les données ARS, Hub'eau ESO et ESU. Je vais tester la jointure avec le référentiel des stations.

Quelques précisions par rapport aux versions précédentes :

• pas de dédoublonnage sur les code_station et date_prelevement
• correction d'un bug pour lequel signe "<" n'était pas supprimé dans le champs limite_quantification pour les données ARS

Champs absents suivants les sources :

• ARS : pas de champs code_reseau, code_fraction_analysee et limite_detection
• Hub'eau : pas de champs heure_prelevement, id_usage, id_prelevement_motif et date_analyse

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Une fois la nouvelle approche validée par les résultats :

• la branche #13 pourra être fusionnée dans dev puis dans master
• les vignettes obsolètes seront retirées de GitLab pages