From 0003b53f7250d809f5fe79031f55e9f4f2f65d30 Mon Sep 17 00:00:00 2001
From: "ronan.vignard" <ronan.vignard@developpement-durable.gouv.fr>
Date: Fri, 7 Feb 2025 11:21:03 +0100
Subject: [PATCH] =?UTF-8?q?Mise=20=C3=A0=20jour=20li=C3=A9e=20au=20changem?=
 =?UTF-8?q?ent=20de=20version=20de=20fusen?=
MIME-Version: 1.0
Content-Type: text/plain; charset=UTF-8
Content-Transfer-Encoding: 8bit

---
 R/create_nitrate_analyse_table.R              |  2 +-
 R/create_nitrate_prelevement_table.R          |  2 +-
 .../creation-des-tables-et-des-sequences.Rmd  | 31 ++++++++++++++-----
 3 files changed, 25 insertions(+), 10 deletions(-)

diff --git a/R/create_nitrate_analyse_table.R b/R/create_nitrate_analyse_table.R
index 8fe0038..38edd7c 100644
--- a/R/create_nitrate_analyse_table.R
+++ b/R/create_nitrate_analyse_table.R
@@ -1,4 +1,4 @@
-# WARNING - Generated by {fusen} from dev/flat_create_tables_sequences.Rmd: do not edit by hand
+# WARNING - Generated by {fusen} from dev/flat_create_tables_sequences.Rmd: do not edit by hand # nolint: line_length_linter.
 
 #' Créer une table d'analyses de nitrates
 #'
diff --git a/R/create_nitrate_prelevement_table.R b/R/create_nitrate_prelevement_table.R
index 6076073..0885610 100644
--- a/R/create_nitrate_prelevement_table.R
+++ b/R/create_nitrate_prelevement_table.R
@@ -1,4 +1,4 @@
-# WARNING - Generated by {fusen} from dev/flat_create_tables_sequences.Rmd: do not edit by hand
+# WARNING - Generated by {fusen} from dev/flat_create_tables_sequences.Rmd: do not edit by hand # nolint: line_length_linter.
 
 #' Créer une table de prélèvements de nitrates
 #'
diff --git a/vignettes/creation-des-tables-et-des-sequences.Rmd b/vignettes/creation-des-tables-et-des-sequences.Rmd
index dd7ee81..6b01aeb 100644
--- a/vignettes/creation-des-tables-et-des-sequences.Rmd
+++ b/vignettes/creation-des-tables-et-des-sequences.Rmd
@@ -2,7 +2,7 @@
 title: "Création des tables et des séquences"
 output: rmarkdown::html_vignette
 vignette: >
-  %\VignetteIndexEntry{creation-des-tables-et-des-sequences}
+  %\VignetteIndexEntry{Création des tables et des séquences}
   %\VignetteEngine{knitr::rmarkdown}
   %\VignetteEncoding{UTF-8}
 ---
@@ -14,13 +14,18 @@ knitr::opts_chunk$set(
 )
 ```
 
-```{r setup}
+```{r}
 library(data.nitrates)
 ```
 
 <!-- WARNING - This vignette is generated by {fusen} from dev/flat_create_tables_sequences.Rmd: do not edit by hand -->
 
-```{r config, eval = FALSE}
+
+
+
+```{r config}
+#| eval: no
+
 # Lire le fichier de configuration
 config <- yaml::read_yaml("config.yml")
 
@@ -29,42 +34,47 @@ version <- config$version
 last_year <- config$last_year
 ```
 
+
 # Présentation
 
 Cette page contient les fonctions permettant :
 - de créer en base les tables `nitrates.nitrate_prelevement_version` et `nitrates.nitrate_analyse_version`,
 - d'incrémenter les séquences correspondantes au moment de l'import des données.
 
-
 # Création des tables en base
 
 ## Création de la table des prélèvements et ajout des commentaires
 
 Création de la table `nitrates.nitrate_prelevement_version` :
+```{r create_nitrate_prelevement_table_version}
+#| eval: no
 
-```{r create_nitrate_prelevement_table_version, eval = FALSE}
 # Création du script SQL avec la version choisie
 sql <- create_nitrate_prelevement_table(version, last_year)
 ```
 
+
 ## Création de la table des analyses et ajout des commentaires
 
 Création de la table `nitrates.nitrate_analyse_version` :
+```{r create_nitrate_analyse_table}
+#| eval: no
 
-```{r create_nitrate_analyse_table, eval = FALSE}
 # Création du script SQL avec la version choisie
 sql <- create_nitrate_analyse_table(version, last_year)
 
 ```
 
+
 # Incrémentation des séquences
 
 ## Incrémentation de la table des prélèvements
 
 La fonction est utilisée au moment d'importer les données des différentes 
 sources dans la table `nitrates.nitrate_prelevement_version` :
+```{r example_add_code_prelevement}
+#| eval: no
 
-```{r example_add_code_prelevement, eval = FALSE}
 # Crée un dataframe fictif avec les colonnes nécessaires pour l'exemple
 dataframe <- data.frame(
   id_prelevement = 1:5,
@@ -79,13 +89,15 @@ dataframe <- add_code_prelevement(
 
 ```
 
+
 ## Incrémentation de la table des analyses
 
 La fonction est utilisée au moment d'importer les données des différentes 
 sources dans la table `nitrates.nitrate_analyse_version` :
 On ajoute un identifiant unique s'appuyant sur une séquence stockée en base :
+```{r example_add_code_analyse}
+#| eval: no
 
-```{r example_add_code_analyse, eval = FALSE}
 # Crée un dataframe fictif avec les colonnes nécessaires pour l'exemple
 dataframe <- data.frame(
   id_prelevement = 1:5,
@@ -100,3 +112,6 @@ dataframe <- add_code_analyse(
 
 ```
 
+
+
+
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